ფაკულტეტის დამხმარე სამეცნიერო სტრუქტურული ერთეულები - სამეცნიერო კვლევითი ინსტიტუტები:
ა) სტატისტიკური კვლევების ინსტიტუტი;
ბ) სისტემების კვლევისა და ინჟინერიის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
გ) არაწრფივი მოვლენების ფიზიკის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
დ) გამოთვლითი ფიზიკის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ე) კონდენსირებული გარემოს ფიზიკისა და პერსპექტიულ მასალათა სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ვ) ნახევარგამტართა ფიზიკის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ზ) გამოყენებითი ნახევრადგამტარული ტექნოლოგიების სამეცნიერო–კვლევითი ინსტიტუტი;
თ) აკადემიკოს ნოდარ კეკელიძის სახელობის ნივთიერებათა კვლევის სამეცნიერო-კვლევითი
ინსტიტუტი; http://www.mritsu.ge/
ი) სამედიცინო და გამოყენებითი ბიოფიზიკის სამეცნიერო-კვლევით ინსტიტუტი;
კ) ბიოფიზიკისა და ბიო-ნანომეცნიერებების სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ლ) მაკრომოლეკულების ქიმიის და პოლიმერული მასალების სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
მ) მეტალორგანული ქიმიის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ნ) ორგანული ქიმიის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ო) ფიზიკური და ანალიზური ქიმიის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
პ) არაორგანულ–ორგანული არატრადიციული ჰიბრიდული მასალების სამეცნიერო– კვლევითი ინსტიტუტი;
ჟ) ბიოორგანული ტექნოლოგიების სამეცნიერო–კვლევითი ინსტიტუტი ;
რ) გენეტიკის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ს) სტრესის ბიოქიმიური მექანიზმების შემსწავლელი სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი; ტ) ბიოეფექტური ტექნოლოგიების ფუნდამენტური კვლევების სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
უ) უჯრედული და მოლეკულური მედიცინის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი ;
ფ) გამოყენებითი ეკოლოგიის ინტერდისციპლინარული სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი ქ) გარემოს დაცვისა და მდგრადი განვითარების სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ტი;
ღ) ელექტრული და ელექტრონული ინჟინერიის სამეცნიერო –კვლევითი ინსტიტუტი;
ყ) ოკეანოგრაფიისა და ჰიდროლოგიის სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი („ოკეანეჰიდრო“); შ) მათემატიკურ განათლებაში სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი;
ჩ) ივანე ჯავახიშვილის სახელობის თბილისის სახელმწიფო უნივერსიტეტის და აიდაჰოს (აშშ)
სახელმწიფო უნივერსიტეტის ერთობლივი სამეცნიერო-კვლევითი ინსტიტუტი.